More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5825 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 848 aa  1695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.41 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.29 
 
 		 468 aa  399  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.07 
 
 		 441 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.27 
 
 		 448 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.98 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.64 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.26 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 432 aa  386  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 444 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.54 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  45.6 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.13 
 
 		 443 aa  379  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.24 
 
 		 431 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.65 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.26 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.74 
 
 		 444 aa  376  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.74 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.98 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.74 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.74 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.87 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.51 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.01 
 
 		 440 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.84 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.01 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 432 aa  365  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 432 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.93 
 
 		 442 aa  364  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.14 
 
 		 433 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.84 
 
 		 431 aa  363  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  43.84 
 
 		 462 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.43 
 
 		 448 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.42 
 
 		 434 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.2 
 
 		 433 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.16 
 
 		 454 aa  353  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.73 
 
 		 433 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.2 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.12 
 
 		 461 aa  351  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.03 
 
 		 443 aa  351  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.78 
 
 		 455 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.06 
 
 		 448 aa  349  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.6 
 
 		 434 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.24 
 
 		 448 aa  347  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.61 
 
 		 449 aa  343  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.16 
 
 		 453 aa  343  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.47 
 
 		 448 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.48 
 
 		 448 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.92 
 
 		 453 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.36 
 
 		 453 aa  337  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.58 
 
 		 429 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.99 
 
 		 453 aa  334  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.76 
 
 		 450 aa  334  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.71 
 
 		 453 aa  334  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.78 
 
 		 452 aa  333  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.35 
 
 		 453 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.35 
 
 		 453 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.63 
 
 		 438 aa  314  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.96 
 
 		 460 aa  310  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  40 
 
 		 451 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.79 
 
 		 451 aa  302  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  39.91 
 
 		 494 aa  302  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.53 
 
 		 416 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.53 
 
 		 416 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.92 
 
 		 441 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 		 357 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  39.11 
 
 		 458 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04012  conserved hypothetical protein  38.72 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.11 
 
 		 352 aa  275  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 		 355 aa  270  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 		 356 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 355 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 355 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 355 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 		 355 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 		 355 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.24 
 
 		 355 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 		 355 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 		 353 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  43.18 
 
 		 355 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 353 aa  253  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 355 aa  251  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 351 aa  250  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 		 358 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 362 aa  249  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 355 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 352 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 354 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 		 355 aa  240  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  44.57 
 
 		 355 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  42.86 
 
 		 352 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>