More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3908 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  100 
 
 
355 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  72.6 
 
 
355 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.34 
 
 
355 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.19 
 
 
355 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.62 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  71.27 
 
 
355 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.9 
 
 
355 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.7 
 
 
355 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.9 
 
 
355 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 
358 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.72 
 
 
352 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.45 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 
355 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.69 
 
 
357 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.97 
 
 
352 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 
356 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
362 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.34 
 
 
355 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
352 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.78 
 
 
355 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.91 
 
 
353 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 
351 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  51.12 
 
 
357 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.69 
 
 
356 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.15 
 
 
355 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.44 
 
 
354 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  51 
 
 
352 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.37 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  50.15 
 
 
357 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
352 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  50.99 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 
351 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 
354 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.57 
 
 
848 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
363 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
379 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
417 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
405 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.53 
 
 
382 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.27 
 
 
382 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
389 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
380 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.08 
 
 
369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
393 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
382 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
382 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  31.25 
 
 
382 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  31.25 
 
 
382 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
383 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  30.94 
 
 
382 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
382 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  31.13 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
391 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.67 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
384 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
393 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
399 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
386 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  31.67 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
384 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  28.17 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  28.17 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.27 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  31.44 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
393 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
358 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
410 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 
384 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
382 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  31.52 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  31.99 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  31.99 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  31.99 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  31.99 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  31.99 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.13 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>