More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2506 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  100 
 
 		 387 aa  786    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.22 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.83 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.6 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.6 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.34 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.64 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.34 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.64 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.38 
 
 		 400 aa  345  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  46.17 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.3 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.26 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.16 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 		 386 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.73 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.6 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.01 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.88 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.56 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.63 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  41.88 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  42.45 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  41.55 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.52 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  42.19 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  40.52 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  42.93 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  42.15 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 		 393 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 387 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  42.15 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  42.15 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  40 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  40.31 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  41.49 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  37.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.31 
 
 		 637 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.77 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 383 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>