More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5727 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.99 
 
 
352 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  62.36 
 
 
357 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.16 
 
 
356 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 
351 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.46 
 
 
352 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 
358 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
355 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.82 
 
 
355 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.68 
 
 
355 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
355 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.27 
 
 
355 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
355 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  55.46 
 
 
355 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.27 
 
 
355 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.46 
 
 
355 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
355 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  53.69 
 
 
355 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.4 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
352 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
362 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  49.86 
 
 
357 aa  348  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
356 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.17 
 
 
355 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
354 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  51.57 
 
 
355 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  47.56 
 
 
352 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 
359 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
351 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 
354 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 
358 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 
363 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.54 
 
 
848 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.01 
 
 
385 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.01 
 
 
385 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  30.56 
 
 
383 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
392 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  30.77 
 
 
381 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
384 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 
405 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
388 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
377 aa  125  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
389 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
340 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
377 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 
384 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 
394 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
383 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
386 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
385 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.81 
 
 
387 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.14 
 
 
369 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
388 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
387 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 
387 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
392 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
382 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.26 
 
 
383 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.73 
 
 
387 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
380 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
377 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
380 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0145  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.73 
 
 
384 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  24.6 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  28.64 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  22.73 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
385 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>