More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4405 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
351 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.53 
 
 
358 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.11 
 
 
358 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.29 
 
 
363 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.57 
 
 
354 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 
354 aa  364  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
356 aa  298  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 
353 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.29 
 
 
357 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
355 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
355 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 
358 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
353 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
352 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
355 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  47.31 
 
 
355 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.33 
 
 
355 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 
355 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
355 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
352 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
355 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.33 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
356 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
362 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.14 
 
 
352 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
355 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  45.04 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  41.81 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  42.5 
 
 
352 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
352 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
352 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
351 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  36.29 
 
 
357 aa  229  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
355 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
352 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.32 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.8 
 
 
848 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
398 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  29.63 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.14 
 
 
369 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
377 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
389 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
417 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
388 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
388 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
389 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
381 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
387 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
381 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
381 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  31.61 
 
 
395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  31.61 
 
 
395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  31.61 
 
 
395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  31.61 
 
 
395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  31.61 
 
 
395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  35.43 
 
 
384 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  27.78 
 
 
381 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  25.48 
 
 
382 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
383 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
384 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
383 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
387 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
384 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
385 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
384 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
382 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
382 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
371 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.13 
 
 
383 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.33 
 
 
383 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
386 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
383 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
384 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>