More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2781 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  80.05 
 
 		 381 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 398 aa  815    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.15 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.11 
 
 		 383 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.82 
 
 		 381 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.08 
 
 		 381 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  70.6 
 
 		 381 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.76 
 
 		 381 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.63 
 
 		 383 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.08 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  60.48 
 
 		 381 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.95 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  60.93 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  60.41 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  55.26 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  55 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.58 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  47.14 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  45.09 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.31 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 378 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  39.14 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 380 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.64 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.16 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.7 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  39.16 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  38.54 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 379 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  39.47 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.29 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.34 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.98 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.98 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 393 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  34.11 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.6 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.13 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  33.42 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  33.16 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.14 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  32.89 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>