More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3335 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  70.77 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.91 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.25 
 
 		 352 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  66 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.97 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.04 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.6 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 		 353 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.19 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.78 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.71 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.78 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.07 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.36 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.04 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.04 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  59.26 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.77 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  61.47 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.71 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  54.11 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  55.91 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 		 356 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  55.32 
 
 		 352 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.14 
 
 		 352 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.69 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.14 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.74 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.97 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.34 
 
 		 848 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.12 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.14 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29 
 
 		 376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.74 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.74 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  30.64 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  28.72 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  29.91 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  28.72 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0145  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.95 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  27.54 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.12 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.47 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.81 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  27.22 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>