More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4672 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.38 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.29 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.86 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.29 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.57 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.32 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.1 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  45.33 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  43.7 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.45 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.22 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  44.24 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  37.22 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  43.91 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.35 
 
 		 848 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  28.04 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.93 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.14 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  28.38 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  28.12 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  28.12 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  27.95 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  30.5 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  30.19 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  30.19 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  30 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  30.19 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  30.19 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.63 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  27.63 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  27.06 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.37 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.06 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.37 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.06 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.06 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.85 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.28 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.9 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  29.81 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.87 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>