More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3377 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  93.24 
 
 
355 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  88.17 
 
 
355 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  97.18 
 
 
355 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.96 
 
 
355 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.4 
 
 
355 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.94 
 
 
355 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  74.58 
 
 
355 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  70.9 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.66 
 
 
352 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.64 
 
 
356 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.41 
 
 
353 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.22 
 
 
358 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.11 
 
 
357 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.35 
 
 
355 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.54 
 
 
355 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.22 
 
 
355 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.3 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.28 
 
 
352 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.69 
 
 
362 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 
355 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  53.98 
 
 
357 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 
351 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  51.56 
 
 
357 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 
356 aa  342  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.99 
 
 
352 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
355 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.15 
 
 
354 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.95 
 
 
359 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  51.28 
 
 
352 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
352 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 
351 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.68 
 
 
848 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 
354 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
358 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
354 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 
358 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.22 
 
 
363 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.06 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
405 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
417 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
384 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  30.27 
 
 
385 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  30.27 
 
 
385 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
394 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.97 
 
 
382 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
388 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
383 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.52 
 
 
382 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  31.86 
 
 
383 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.52 
 
 
382 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.97 
 
 
382 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.97 
 
 
382 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
382 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
386 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
387 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.47 
 
 
358 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
391 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  26.39 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.75 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
382 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
388 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.11 
 
 
382 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
384 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
887 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  29.55 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  29.55 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  29.22 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.64 
 
 
386 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
383 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
395 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
382 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
389 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.02 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.57 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
858 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
387 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.25 
 
 
390 aa  116  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
382 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.18 
 
 
637 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
393 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
385 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>