More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1166 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  768    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.5 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.58 
 
 
382 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.32 
 
 
382 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
390 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
382 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
382 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
386 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  37.27 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.43 
 
 
382 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
387 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
395 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
382 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
383 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
384 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
385 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
382 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 
358 aa  226  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
382 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
382 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  37.3 
 
 
382 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.05 
 
 
385 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
382 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.05 
 
 
385 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
384 aa  223  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  37.74 
 
 
390 aa  222  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.87 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  37.47 
 
 
390 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.77 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
387 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  36.32 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
405 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
386 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37 
 
 
383 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
384 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
382 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
387 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
383 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.44 
 
 
637 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  36.46 
 
 
390 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  36.87 
 
 
395 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
385 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.93 
 
 
381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
382 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
383 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  36.2 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
383 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  36.34 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
388 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  36.34 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  36.34 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 
383 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
390 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
387 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 
387 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.64 
 
 
393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  36.17 
 
 
415 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
395 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
387 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  36.34 
 
 
395 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
398 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
382 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  36.17 
 
 
415 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
383 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  36.17 
 
 
490 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  36.46 
 
 
383 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
387 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  209  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  36.07 
 
 
395 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
383 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
383 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
393 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
391 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
382 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>