More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1233 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 		 382 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 		 393 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.88 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.43 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  44.86 
 
 		 388 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 381 aa  282  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.43 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 387 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  41.89 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.4 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.19 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  38.92 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  42.32 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.26 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  44.07 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.4 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.86 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 		 387 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  41.13 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  43.16 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 		 383 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 393 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.87 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  40.59 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 		 387 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 387 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  39.84 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  40.27 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  39.84 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.7 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>