More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2290 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
394 aa  798    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
395 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.51 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
388 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 
388 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
387 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
377 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.66 
 
 
382 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
387 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
393 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.4 
 
 
382 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
384 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
395 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
382 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
391 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
389 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
392 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
387 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
406 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
387 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.01 
 
 
382 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  32.99 
 
 
383 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.41 
 
 
388 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.31 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  33.08 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.31 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
393 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
387 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
387 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
390 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
387 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
399 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
386 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
386 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
376 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
399 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
402 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0153  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
396 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.264412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
388 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35 
 
 
381 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
387 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.04 
 
 
387 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
393 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.6 
 
 
388 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
872 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  35.84 
 
 
382 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 
391 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.36 
 
 
393 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
380 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
388 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  32.82 
 
 
389 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
381 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
378 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
382 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  37.07 
 
 
383 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
405 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
382 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
379 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
382 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 
388 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
390 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
387 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
377 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
382 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
410 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
887 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.85 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  34.85 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
382 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
382 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
382 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
395 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>