More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
386 aa  779    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  76.58 
 
 
384 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.74 
 
 
385 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.09 
 
 
386 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  70.91 
 
 
386 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.35 
 
 
386 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  66.84 
 
 
386 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.21 
 
 
390 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.12 
 
 
387 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.92 
 
 
388 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.52 
 
 
387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.7 
 
 
388 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.4 
 
 
387 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.64 
 
 
385 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.2 
 
 
385 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 
393 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.61 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
390 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  49.16 
 
 
387 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.56 
 
 
398 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
392 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.04 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.04 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 
399 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.23 
 
 
384 aa  308  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.52 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.78 
 
 
400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.99 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.52 
 
 
400 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
395 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
383 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
383 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 
382 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  38.22 
 
 
382 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
383 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 
382 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.52 
 
 
381 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
402 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  255  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
383 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.5 
 
 
382 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.84 
 
 
393 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
382 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
382 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
887 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
393 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.85 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
382 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2072  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
891 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2165  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
891 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.438641  normal  0.324507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1709  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
867 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1983  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
891 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1963  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
891 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.977003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
872 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2284  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
892 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
358 aa  242  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2704  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
890 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000877168  hitchhiker  0.00175992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2197  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
900 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.817731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.25 
 
 
382 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.31 
 
 
382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03018  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
900 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1955  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
901 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.99 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.31 
 
 
382 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  37.76 
 
 
382 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.31 
 
 
382 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.31 
 
 
382 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.31 
 
 
382 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  37.86 
 
 
382 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
383 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 
387 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
382 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
382 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>