More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0080 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 		 384 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.43 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.43 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 		 395 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.17 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  45.53 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 399 aa  359  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  44.91 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  44.65 
 
 		 400 aa  355  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 		 400 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.43 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.43 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  46.3 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.16 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.85 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 		 385 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 		 388 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.12 
 
 		 386 aa  305  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.16 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 387 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  39.95 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.69 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  36.91 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.89 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 387 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  39.04 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.04 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  37.4 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.14 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.98 
 
 		 382 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  34.95 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.97 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  34.68 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  39.03 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 383 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.7 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  34.41 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>