More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1481 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.56 
 
 
383 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.77 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.2 
 
 
382 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.68 
 
 
382 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  68.77 
 
 
383 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 
382 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.9 
 
 
382 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
382 aa  541  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  67.45 
 
 
383 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 
382 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  67.89 
 
 
381 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  67.72 
 
 
383 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  67.72 
 
 
383 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.45 
 
 
383 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  67.72 
 
 
383 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  67.45 
 
 
383 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  67.72 
 
 
383 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  67.72 
 
 
383 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.28 
 
 
402 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  69.63 
 
 
382 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  67.45 
 
 
383 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.06 
 
 
382 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  67.45 
 
 
383 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  67.02 
 
 
382 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  69.84 
 
 
382 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.77 
 
 
383 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.49 
 
 
382 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.23 
 
 
382 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.32 
 
 
382 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  66.23 
 
 
382 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
382 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
382 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
382 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  69.11 
 
 
382 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.32 
 
 
382 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  65.71 
 
 
382 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  66.23 
 
 
382 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.32 
 
 
382 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.32 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.32 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  65.45 
 
 
383 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.81 
 
 
383 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.89 
 
 
382 aa  498  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.53 
 
 
383 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.94 
 
 
387 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.47 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.73 
 
 
387 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.87 
 
 
387 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.77 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.2 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.88 
 
 
387 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.52 
 
 
388 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  55.47 
 
 
393 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.4 
 
 
383 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.08 
 
 
387 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 
383 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
387 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.35 
 
 
387 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 
383 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  57.74 
 
 
490 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.69 
 
 
389 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  57.74 
 
 
415 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  57.74 
 
 
415 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.22 
 
 
637 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
383 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  56.88 
 
 
390 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.9 
 
 
393 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  55.29 
 
 
388 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 
384 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
393 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  56.88 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.69 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  56.35 
 
 
390 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.93 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 
387 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  48.81 
 
 
389 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  48.16 
 
 
385 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  48.16 
 
 
385 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  48.82 
 
 
383 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  44.33 
 
 
390 aa  334  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
390 aa  322  8e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  43.98 
 
 
382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  43.72 
 
 
382 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  43.46 
 
 
382 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  43.46 
 
 
382 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  44.5 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  44.5 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  44.5 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  44.5 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  44.24 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 
388 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  40.52 
 
 
382 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 
387 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
387 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  40 
 
 
382 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
384 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>