More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2211 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  766    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.99 
 
 
387 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.19 
 
 
387 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.14 
 
 
388 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.64 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.07 
 
 
385 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  55.32 
 
 
386 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.07 
 
 
386 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.84 
 
 
387 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
390 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.43 
 
 
386 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
384 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
385 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.77 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 
388 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.64 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
390 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 
390 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
395 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  45.72 
 
 
387 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 
398 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.56 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 
400 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.56 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.56 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.45 
 
 
400 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.04 
 
 
400 aa  299  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.19 
 
 
400 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40 
 
 
384 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.86 
 
 
399 aa  288  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
383 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  39.69 
 
 
383 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
383 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 
382 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 
383 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
383 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
382 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
382 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
383 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
382 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  40.31 
 
 
382 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  39.42 
 
 
382 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.83 
 
 
381 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
382 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
402 aa  245  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
382 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
382 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
382 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  39.74 
 
 
382 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  39.15 
 
 
388 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
382 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
382 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
382 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2727  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.639265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
382 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
382 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
382 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
383 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
382 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.77 
 
 
382 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.51 
 
 
382 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
887 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
383 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
387 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
383 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 
387 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.96 
 
 
376 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
387 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1385  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
389 aa  227  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.53 
 
 
393 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
382 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
393 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
387 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
387 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>