More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6437 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.73 
 
 
387 aa  484  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.47 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.91 
 
 
386 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.83 
 
 
387 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.26 
 
 
385 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
384 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
386 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  50.78 
 
 
386 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
386 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
385 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.64 
 
 
385 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 
386 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.15 
 
 
390 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.7 
 
 
388 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.19 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
390 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
390 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  41.58 
 
 
387 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
395 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
398 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
400 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.12 
 
 
384 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.52 
 
 
400 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
400 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.52 
 
 
400 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.01 
 
 
400 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.42 
 
 
400 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
392 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.68 
 
 
400 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.17 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.66 
 
 
400 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
382 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2727  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 
391 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.639265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
368 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
393 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
872 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
383 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
382 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
378 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
393 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
383 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.24 
 
 
376 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
387 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
384 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  34.79 
 
 
369 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.86 
 
 
387 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.44 
 
 
388 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
382 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.49 
 
 
393 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
385 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.42 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
867 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
867 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
887 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
391 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2044  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
871 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
383 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
382 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
867 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
867 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
867 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4218  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
867 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
867 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2165  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
891 aa  195  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.438641  normal  0.324507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2072  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
891 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1963  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
891 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.977003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
393 aa  196  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
393 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
388 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
867 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.3 
 
 
383 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
382 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
385 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2704  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
890 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000877168  hitchhiker  0.00175992 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
387 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  34.3 
 
 
382 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
388 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.3 
 
 
382 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.3 
 
 
382 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.3 
 
 
383 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2136  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
866 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4267  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
867 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4599  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
867 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
383 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
383 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>