More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1960 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.84 
 
 
351 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.49 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 
355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.2 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.02 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.17 
 
 
356 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.73 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.45 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  55.03 
 
 
357 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  60.56 
 
 
355 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.91 
 
 
358 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.73 
 
 
355 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
352 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
352 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 
352 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 
353 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.94 
 
 
355 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.41 
 
 
355 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 
355 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  56.76 
 
 
357 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.78 
 
 
355 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 
362 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
352 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.69 
 
 
355 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 
353 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  59.15 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.87 
 
 
354 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  52.19 
 
 
352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 
359 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
354 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 
351 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
358 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.23 
 
 
354 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.32 
 
 
848 aa  228  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
363 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
417 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
379 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
358 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.4 
 
 
369 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
382 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
382 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
387 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  32.65 
 
 
490 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.6 
 
 
376 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  32.65 
 
 
415 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
382 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
382 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
387 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.35 
 
 
637 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  29.6 
 
 
382 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  32.65 
 
 
415 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
382 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
383 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
382 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
382 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
385 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 
389 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  28.53 
 
 
381 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
382 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
382 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.04 
 
 
385 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
382 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
382 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  31.8 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.39 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.71 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>