More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1435 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  92.15 
 
 
382 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  83.51 
 
 
382 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  98.69 
 
 
382 aa  762    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  80.63 
 
 
382 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  773    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  80.37 
 
 
382 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.1 
 
 
382 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  78.8 
 
 
382 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  78.53 
 
 
382 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  71.47 
 
 
382 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.85 
 
 
378 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
378 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.28 
 
 
378 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.59 
 
 
378 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 
378 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  68.59 
 
 
378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.49 
 
 
378 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.14 
 
 
376 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.81 
 
 
380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.11 
 
 
380 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
380 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 
377 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  49.08 
 
 
370 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
379 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  53 
 
 
377 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 
378 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
381 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
398 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
383 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 
381 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.25 
 
 
381 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
381 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
392 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  36.55 
 
 
386 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  36.29 
 
 
386 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  37.56 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
381 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
389 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
383 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
392 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
384 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
378 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
377 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
381 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
388 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.24 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.98 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  35.77 
 
 
384 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 
384 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
388 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
394 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
382 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
390 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  35.23 
 
 
383 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  34.76 
 
 
382 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
393 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
389 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.84 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
394 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
387 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
393 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
387 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
382 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
382 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
406 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
383 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
387 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
383 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.42 
 
 
382 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.42 
 
 
382 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
381 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
399 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  33.59 
 
 
382 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  33.59 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  33.59 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  33.59 
 
 
382 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.51 
 
 
393 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  33.59 
 
 
382 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
382 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>