More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4891 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.64 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.46 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 		 358 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  55.84 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.18 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.02 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.61 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  54.49 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.17 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  52.16 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.08 
 
 		 355 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  55.79 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  53.12 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 		 352 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.3 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.42 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.69 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 		 355 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.68 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  53.69 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 		 352 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.63 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.97 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 358 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.22 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.83 
 
 		 848 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.75 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  33.59 
 
 		 382 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  33.62 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.64 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.38 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.42 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  27.49 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.03 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.52 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  28.5 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  28.76 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>