More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1316 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  84.82 
 
 
382 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  80.63 
 
 
382 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  85.08 
 
 
382 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  84.29 
 
 
382 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  79.06 
 
 
382 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  80.63 
 
 
382 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  77.23 
 
 
382 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  81.41 
 
 
382 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.16 
 
 
378 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 
378 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.59 
 
 
378 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.68 
 
 
378 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.94 
 
 
378 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 
378 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  69.63 
 
 
378 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.8 
 
 
378 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.16 
 
 
380 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.11 
 
 
380 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.99 
 
 
376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 
377 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  51.31 
 
 
370 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
379 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
377 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
378 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
381 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
398 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
381 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
381 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
381 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
381 aa  245  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
383 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  34.2 
 
 
386 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  35.77 
 
 
381 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  33.94 
 
 
386 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
389 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
378 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
381 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
377 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 
392 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
383 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.4 
 
 
389 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.14 
 
 
389 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  36.36 
 
 
384 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
388 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
384 aa  209  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
388 aa  209  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
387 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.07 
 
 
385 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
390 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.07 
 
 
385 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
387 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.84 
 
 
382 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.84 
 
 
382 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
399 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
384 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  34.7 
 
 
383 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
382 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.69 
 
 
381 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
402 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.48 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
383 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.42 
 
 
393 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
394 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
382 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.94 
 
 
381 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  37.2 
 
 
383 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.44 
 
 
388 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
382 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
385 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
386 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
387 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
382 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  34.85 
 
 
389 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
387 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
383 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
387 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
393 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>