More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3781 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 397 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 377 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 368 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.08 
 
 		 387 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 		 373 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.39 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  46.26 
 
 		 387 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 388 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 392 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  41.49 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.42 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 383 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 378 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  38.44 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  38.71 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  39.25 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  39.25 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  38.71 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  38.71 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  39.25 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  38.54 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  39.25 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  38.71 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  38.44 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  38.44 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.41 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  37.28 
 
 		 387 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>