More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2653 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
414 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
399 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 
379 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  42 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
409 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
392 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
393 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
392 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
397 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  38.11 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
384 aa  213  7e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
385 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
387 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.67 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
384 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
385 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
399 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
385 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
410 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
385 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
385 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3657  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
420 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
389 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  31.7 
 
 
381 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
385 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
385 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
386 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
383 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
385 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  30.75 
 
 
390 aa  193  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
386 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
389 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
389 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
383 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  30.79 
 
 
394 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
383 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
395 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.45 
 
 
637 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
418 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
382 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.7 
 
 
382 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
382 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.7 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
358 aa  189  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
382 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
398 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
388 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
388 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
388 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
386 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
388 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
387 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
383 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
395 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
382 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
382 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  33.66 
 
 
415 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.22 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.56 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
387 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  33.66 
 
 
415 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
387 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
380 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
384 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.56 
 
 
400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  33.66 
 
 
490 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  31.54 
 
 
382 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
387 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.56 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.56 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.66 
 
 
386 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  33.08 
 
 
388 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
382 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  30.77 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>