More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4422 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  98.97 
 
 
388 aa  783    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  75 
 
 
402 aa  587  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.23 
 
 
388 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.89 
 
 
389 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.89 
 
 
389 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 
385 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
387 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.44 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  57.66 
 
 
385 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  57.66 
 
 
385 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  57.66 
 
 
385 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.88 
 
 
385 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  57.66 
 
 
385 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
385 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 
387 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
387 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  56.96 
 
 
387 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.52 
 
 
392 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 
382 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.25 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
393 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  52.84 
 
 
387 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 
387 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
392 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
391 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
380 aa  349  5e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 
384 aa  335  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  49.35 
 
 
392 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
387 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 
387 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
387 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
405 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
393 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
397 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
387 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
382 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
389 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
386 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.93 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 
388 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
384 aa  212  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 
388 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 
388 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.9 
 
 
388 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  37.82 
 
 
385 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
387 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  37.54 
 
 
385 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  36.62 
 
 
387 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
385 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
381 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
383 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
385 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
383 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
384 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.03 
 
 
393 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
368 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
383 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
384 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  34.9 
 
 
389 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
387 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.64 
 
 
382 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.38 
 
 
382 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
378 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
403 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
400 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  37.57 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
386 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
388 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.24 
 
 
386 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  35.69 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  35.69 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  35.69 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  35.69 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  35.41 
 
 
395 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  36.44 
 
 
394 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.23 
 
 
386 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>