More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5929 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  92.76 
 
 
387 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  81.91 
 
 
387 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  72.61 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.13 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.03 
 
 
387 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.96 
 
 
402 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.54 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.41 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.9 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.03 
 
 
382 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.1 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  59.9 
 
 
385 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  60.41 
 
 
385 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  55.93 
 
 
388 aa  401  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 
385 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
388 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.51 
 
 
392 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.72 
 
 
384 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.15 
 
 
391 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.02 
 
 
393 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.05 
 
 
392 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.04 
 
 
380 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  55.7 
 
 
392 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 
386 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
387 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 
387 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.96 
 
 
397 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
405 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 
393 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.29 
 
 
387 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
382 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
395 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
388 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
383 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
377 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.46 
 
 
388 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
387 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
387 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
387 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
377 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  47 
 
 
368 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
389 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
386 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
410 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
385 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 
375 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 
375 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
872 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
388 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  38.06 
 
 
369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
418 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
381 aa  215  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  39.12 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
383 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
399 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
383 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.91 
 
 
393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
368 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
383 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 
385 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
386 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
384 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.14 
 
 
382 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.66 
 
 
388 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.14 
 
 
382 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
386 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
388 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
388 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.14 
 
 
382 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
383 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.14 
 
 
382 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
398 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.14 
 
 
382 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.75 
 
 
389 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
394 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
383 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
378 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
390 aa  205  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.51 
 
 
386 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
383 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>