More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6274 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  95.23 
 
 
377 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.1 
 
 
377 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.16 
 
 
375 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.43 
 
 
375 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.7 
 
 
392 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.43 
 
 
373 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.84 
 
 
368 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 
397 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
383 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
405 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
385 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 
382 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
393 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.79 
 
 
387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
385 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
387 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
382 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
380 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
387 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
410 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
402 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
388 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
388 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
385 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
385 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
388 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
388 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
379 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
388 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
388 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
392 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
384 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
389 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
392 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
389 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
393 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
387 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
418 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
388 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
384 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  38.53 
 
 
392 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
386 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
387 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
398 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
398 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
386 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
391 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
399 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
409 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
387 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
390 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
385 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
381 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
381 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
382 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
386 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
408 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
381 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
385 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
383 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
382 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
388 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
381 aa  176  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.29 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  33.69 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.79 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.79 
 
 
382 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
388 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
387 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
383 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
385 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
381 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
378 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
382 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.39 
 
 
400 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
400 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.39 
 
 
400 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
392 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.21 
 
 
400 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  28.95 
 
 
383 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>