More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2726 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  785    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  60 
 
 		 386 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.75 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.14 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.14 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  55.09 
 
 		 387 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.83 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.53 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.07 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.84 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  51.72 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.95 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.65 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.08 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 		 382 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.23 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  47.63 
 
 		 383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 		 382 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.83 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  43.65 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.93 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  43.88 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 382 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  42.82 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.1 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.29 
 
 		 387 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.82 
 
 		 637 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  42.67 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  42.59 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  42.55 
 
 		 415 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  42.55 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  42.55 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  40.74 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  42.02 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  42.29 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  42.02 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 382 aa  285  5.999999999999999e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 388 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.05 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>