More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2250 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  55 
 
 		 386 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.41 
 
 		 388 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.05 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.5 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  51.56 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 		 387 aa  401  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 		 387 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.42 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.13 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.08 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.22 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.8 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.93 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 		 388 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  41.11 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 406 aa  291  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.64 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.67 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.22 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  39.78 
 
 		 382 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.42 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 382 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 380 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 382 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  40.05 
 
 		 415 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  40.48 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  40.48 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.21 
 
 		 637 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.28 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 383 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  39.57 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  40.05 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  39.04 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  38.5 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  39.79 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 382 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 383 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  40.27 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  39.04 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.5 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.96 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.96 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  39.04 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.07 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>