More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  89.92 
 
 
387 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  97.67 
 
 
387 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  86.3 
 
 
387 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  86.56 
 
 
387 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  86.3 
 
 
387 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.01 
 
 
386 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.27 
 
 
386 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.83 
 
 
385 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
388 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.75 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
403 aa  408  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.58 
 
 
387 aa  397  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  50.65 
 
 
388 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 
386 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.57 
 
 
386 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
384 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 
383 aa  378  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
379 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
382 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
382 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
382 aa  332  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
406 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
388 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 
402 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
382 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  41.25 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
388 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.25 
 
 
410 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
382 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
382 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
382 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
382 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
382 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
382 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
382 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  40.58 
 
 
388 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
382 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
382 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
382 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
383 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
386 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  39.05 
 
 
382 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  39.79 
 
 
382 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
402 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
382 aa  289  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
382 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
382 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  36.75 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.99 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.73 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
382 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
387 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
393 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
382 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
393 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  39.26 
 
 
415 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  39.26 
 
 
415 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
393 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  39.26 
 
 
490 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
387 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
387 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.64 
 
 
393 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
382 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
387 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
389 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
383 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
384 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
388 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.46 
 
 
637 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
382 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
382 aa  273  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
399 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  272  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  38.46 
 
 
390 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  38.2 
 
 
390 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
382 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.68 
 
 
382 aa  269  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
383 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.72 
 
 
385 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  38.2 
 
 
390 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.72 
 
 
385 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  38.96 
 
 
383 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
380 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
393 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
380 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>