More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1986 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  96.6 
 
 		 382 aa  749    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 382 aa  774    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.94 
 
 		 382 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  76.18 
 
 		 382 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  67.02 
 
 		 383 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.52 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.21 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.53 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.56 
 
 		 388 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  47.09 
 
 		 388 aa  348  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.75 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 382 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.5 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  45.53 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.83 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.56 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.68 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 		 382 aa  332  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  43.57 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 		 383 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.83 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  44.03 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.56 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  44.3 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  44.03 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  43.68 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.71 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  43.38 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  43.38 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.2 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 393 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  43.68 
 
 		 382 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  42.11 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  42.97 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 		 383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.16 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  40.47 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.01 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  42.74 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  40.99 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>