More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3877 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 386 aa  784    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  97.67 
 
 		 386 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.58 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.47 
 
 		 387 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.47 
 
 		 387 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.12 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.06 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.95 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  58.27 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 403 aa  450  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.02 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.24 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  55 
 
 		 387 aa  424  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.32 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  51.32 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 		 386 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.43 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.06 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 		 410 aa  338  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  44.33 
 
 		 383 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  42.59 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.48 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  42.22 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  42.82 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  42.82 
 
 		 490 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.82 
 
 		 637 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 387 aa  292  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.31 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  39.31 
 
 		 382 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 384 aa  288  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 382 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  40.05 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  41.11 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 382 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.06 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  38.52 
 
 		 382 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  40.58 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  40.85 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.1 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  38.79 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  35.84 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  38.18 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  38.36 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>