More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0381 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  81.4 
 
 		 387 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  81.91 
 
 		 387 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  74.68 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.68 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.7 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.96 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.36 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  58.61 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  58.06 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 		 385 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.02 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.02 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.1 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  58.87 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.76 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.76 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.12 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.14 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  55.7 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.51 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 387 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.33 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 375 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.66 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.87 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.16 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.71 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  37.76 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  37.76 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 		 887 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  37.76 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  37.76 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  37.76 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.03 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.28 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  36.88 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  36.88 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  36.88 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  36.88 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  36.62 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 		 872 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  37.39 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  36.36 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>