More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00437 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 382 aa  770    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 392 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  39.25 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 384 aa  239  9e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  38.17 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  38.56 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.83 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 872 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.79 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.83 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.79 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 887 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.28 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.89 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 		 388 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 382 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 382 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.28 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.63 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.9 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.26 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 400 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  35.38 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  39 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>