More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7023 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.05 
 
 		 392 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  78.65 
 
 		 391 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  77.63 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.84 
 
 		 392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.92 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.09 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  54.26 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  54.26 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.26 
 
 		 384 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  54.26 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  49.48 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 		 385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.85 
 
 		 380 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  49.23 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.8 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.57 
 
 		 389 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.57 
 
 		 389 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.63 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.48 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  55.7 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  55.18 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  55.7 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.33 
 
 		 388 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.66 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 		 414 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.94 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.86 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  37.88 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  35.01 
 
 		 385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.66 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.22 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.73 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  34.04 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.67 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.5 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.5 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.29 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 392 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.42 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.42 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 388 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.43 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.15 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.62 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.42 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>