More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1261 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 381 aa  772    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  44.21 
 
 		 388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  42.59 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  42.78 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  41.47 
 
 		 389 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 382 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.05 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  39.79 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  42.82 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 382 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  41.73 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  42.74 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.19 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  40.58 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  40.31 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  42.56 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.32 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  40.05 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.32 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.32 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  39.32 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.32 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.32 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.37 
 
 		 637 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  39.06 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  39.06 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  39.79 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  39.84 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  39.84 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  39.84 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  40.53 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>