More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4439 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  92.15 
 
 		 382 aa  729    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  99.21 
 
 		 382 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  79.84 
 
 		 382 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  99.74 
 
 		 382 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  100 
 
 		 382 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  79.84 
 
 		 382 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  80.1 
 
 		 382 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  99.21 
 
 		 382 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  99.21 
 
 		 382 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.86 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  46.6 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  47.87 
 
 		 381 aa  358  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 		 384 aa  357  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 		 382 aa  352  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  47.38 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  46.81 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 383 aa  345  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 		 382 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  46.54 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  47.4 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 383 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  48.95 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 382 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 382 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  47.38 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.21 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.17 
 
 		 383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.61 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  45.36 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 		 387 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.29 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 		 389 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  47.38 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  46.46 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 		 387 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  47.12 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  47.61 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  47.61 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  47.61 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 383 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.8 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.34 
 
 		 637 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.56 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.3 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.57 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.21 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.21 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.83 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.21 
 
 		 382 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  42.89 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.89 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.89 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.89 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.89 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>