More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0621 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  96.61 
 
 		 383 aa  753    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  83.55 
 
 		 383 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  82.25 
 
 		 383 aa  659    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  72.85 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.85 
 
 		 383 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.58 
 
 		 383 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.85 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.58 
 
 		 383 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.32 
 
 		 383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  72.32 
 
 		 383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.58 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.8 
 
 		 382 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.11 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.11 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.11 
 
 		 382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.28 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  64.4 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  63.87 
 
 		 382 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  56.43 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  55.24 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 		 384 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 		 382 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.36 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  42.51 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  42.82 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  41.1 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  41.62 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.04 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  43.7 
 
 		 388 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  45.67 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 389 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  45.41 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  45.14 
 
 		 382 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  41.21 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 		 383 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  43.57 
 
 		 382 aa  282  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  43.83 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  43.83 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  43.83 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  43.83 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  43.83 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  41.91 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  41.64 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 393 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 		 399 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.11 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>