More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0521 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  774    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
397 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
377 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
377 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 
377 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
375 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
375 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
391 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 
392 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
392 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
387 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
395 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
405 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
388 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 
388 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 
385 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
385 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  39.72 
 
 
385 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  42.07 
 
 
392 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 
385 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
385 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
382 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
380 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.72 
 
 
387 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
388 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
386 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
388 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
389 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
388 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
390 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
395 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 
384 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
388 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
402 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 
400 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
392 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
378 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
398 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
378 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
388 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
378 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
400 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 
400 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
388 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 
387 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
389 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.7 
 
 
400 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
378 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
389 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.7 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
408 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
387 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 
400 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
383 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
382 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
381 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
387 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
387 aa  186  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
384 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
379 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
384 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  31.2 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  35.69 
 
 
395 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  35.41 
 
 
395 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  35.41 
 
 
395 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  35.41 
 
 
395 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
395 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  35.41 
 
 
395 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  35.41 
 
 
395 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
395 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
385 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  31.65 
 
 
388 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
391 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  34.56 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>