More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0105 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 408 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.1 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.71 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  54.36 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  37.41 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3657  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 		 395 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  37.06 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.66 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.48 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.37 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.37 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.37 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  35.68 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  33.6 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 		 392 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.68 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.5 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.83 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.83 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  34.35 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.66 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  35.99 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1910  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 		 872 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358145  unclonable  0.00000423199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  36.92 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  35.48 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  35.48 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  35.48 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  35.81 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  36.92 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  37.14 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  36.92 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  36.92 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>