More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2720 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
437 aa  883    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 
410 aa  293  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  35.57 
 
 
425 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
428 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
428 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
422 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
428 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
427 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
395 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
405 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.41 
 
 
389 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
452 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 
408 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 
386 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
384 aa  196  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.49 
 
 
382 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  31.97 
 
 
494 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.12 
 
 
388 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.25 
 
 
382 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
387 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.99 
 
 
400 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
400 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
382 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
400 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.22 
 
 
400 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.99 
 
 
400 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.22 
 
 
400 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
379 aa  186  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
392 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.92 
 
 
400 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
387 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
381 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
388 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
398 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
387 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
433 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  33.73 
 
 
390 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
382 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
390 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
387 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
387 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.46 
 
 
400 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
400 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
388 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
388 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
383 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
382 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
389 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  30.9 
 
 
465 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
382 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
387 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
395 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
383 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
392 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
387 aa  176  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  32.3 
 
 
381 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
435 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  33.01 
 
 
390 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  33.25 
 
 
390 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  32.6 
 
 
382 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
382 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 
386 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
382 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
382 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
388 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
393 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
382 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
382 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
382 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
382 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
393 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  32.36 
 
 
382 aa  169  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
409 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
393 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  30.79 
 
 
390 aa  169  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
382 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
384 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  30.86 
 
 
385 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  30.86 
 
 
385 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>