More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2381 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  868    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.55 
 
 
422 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.92 
 
 
428 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.2 
 
 
452 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  53.44 
 
 
425 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.47 
 
 
427 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.08 
 
 
428 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.24 
 
 
418 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.96 
 
 
429 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  46.77 
 
 
494 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 
433 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.7 
 
 
435 aa  358  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
435 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  42.72 
 
 
465 aa  335  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  41.29 
 
 
519 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
410 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
437 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
392 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
387 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
383 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
393 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
405 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
392 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  32.78 
 
 
392 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
391 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
391 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  31.37 
 
 
388 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  30.94 
 
 
389 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
388 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
382 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
393 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
393 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
382 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
387 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
395 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
387 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
379 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
388 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
385 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
382 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
390 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
382 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
390 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
387 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  31.09 
 
 
387 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
418 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
405 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.23 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
385 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
398 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
387 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.98 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
393 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.62 
 
 
382 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
397 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.85 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.38 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.38 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
392 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
402 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  29.98 
 
 
382 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.91 
 
 
387 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
387 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
378 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
385 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.58 
 
 
387 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  28.43 
 
 
390 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.38 
 
 
382 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
399 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
387 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.38 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.38 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.38 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
395 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
387 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>