More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1823 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.29 
 
 
427 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
429 aa  876    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  72 
 
 
428 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.29 
 
 
418 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  62.86 
 
 
425 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.96 
 
 
428 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.49 
 
 
422 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.76 
 
 
452 aa  378  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
428 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.86 
 
 
435 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0239649 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  42.99 
 
 
494 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  39.91 
 
 
465 aa  286  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  38.53 
 
 
519 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
410 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
437 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 
393 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
392 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
395 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
393 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
387 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 
405 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  32.17 
 
 
415 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  32.17 
 
 
490 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  32.43 
 
 
415 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  31.87 
 
 
381 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
382 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 
382 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
387 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  32.62 
 
 
388 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  31.9 
 
 
390 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
383 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  32.14 
 
 
390 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
382 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  31.9 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
384 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
393 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.68 
 
 
637 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 
383 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.49 
 
 
382 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.98 
 
 
382 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
382 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
387 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
393 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
382 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
387 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
390 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
382 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
382 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  30.9 
 
 
382 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.26 
 
 
388 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
390 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  30.71 
 
 
382 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 
400 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
402 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
382 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 
387 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
382 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
382 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  31.45 
 
 
382 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
382 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.68 
 
 
400 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
385 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  30.36 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
382 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
384 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
400 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.44 
 
 
400 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.44 
 
 
400 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  29.31 
 
 
389 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
392 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
391 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
385 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.28 
 
 
393 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
393 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>