More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1584 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  777    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
387 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 
391 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
382 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
392 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
385 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.7 
 
 
388 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
382 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
405 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 
393 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
382 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
387 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.23 
 
 
387 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
386 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
382 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
382 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
390 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
382 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
382 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.84 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
382 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
383 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
388 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  36.39 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  36.56 
 
 
392 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
388 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
382 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  34.91 
 
 
389 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
393 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
382 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
382 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
382 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
385 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
399 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
402 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
385 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
402 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
385 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
384 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
385 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
385 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
393 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
383 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
382 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
382 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
387 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
383 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
388 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
382 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
387 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
382 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
387 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
382 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
388 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  34.46 
 
 
382 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
388 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.42 
 
 
637 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
410 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
387 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  34.22 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.07 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.07 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
410 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  35.15 
 
 
415 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  35.2 
 
 
415 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
382 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
387 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
383 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
387 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  35.15 
 
 
490 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  32.44 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
382 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
393 aa  199  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
382 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  33.17 
 
 
425 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>