More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0425 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 386 aa  785    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.85 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.76 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  53.77 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  54.03 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.77 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 385 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.07 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.88 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 		 385 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.86 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.86 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  52.09 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  51.17 
 
 		 387 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.13 
 
 		 384 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 		 387 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  53.51 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 		 397 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.33 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.82 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.56 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.82 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.82 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  35.57 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 		 379 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  35.29 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.63 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 388 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  34.56 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.11 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  33.24 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>