More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4061 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  769    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  77.2 
 
 
385 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  78.24 
 
 
385 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  78.76 
 
 
385 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  78.76 
 
 
385 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  78.76 
 
 
385 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  76.94 
 
 
385 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  78.5 
 
 
385 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  77.72 
 
 
385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.53 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
388 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  59.01 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.63 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 
389 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 
389 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.75 
 
 
380 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  58.61 
 
 
387 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.85 
 
 
386 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  58.1 
 
 
387 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
391 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 
387 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.97 
 
 
392 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.21 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.47 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.65 
 
 
382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.83 
 
 
387 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.94 
 
 
393 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.49 
 
 
392 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.68 
 
 
384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  51.42 
 
 
392 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
387 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 
387 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
397 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
405 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
387 aa  242  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
389 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
393 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
388 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
382 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
382 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
388 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
395 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
388 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
381 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
395 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
382 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
368 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
389 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
383 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
398 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
385 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.54 
 
 
388 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
384 aa  205  9e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
383 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.77 
 
 
387 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
383 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
399 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
410 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
390 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
390 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.23 
 
 
382 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  39.09 
 
 
369 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.45 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
383 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
393 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
383 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
383 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
382 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  35.17 
 
 
395 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.98 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  36.97 
 
 
394 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.24 
 
 
386 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.98 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
392 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  35.17 
 
 
395 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
395 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  35.17 
 
 
395 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
388 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
387 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  34.91 
 
 
395 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.64 
 
 
387 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  34.91 
 
 
395 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>