More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0779 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  90.05 
 
 		 392 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 392 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  82.14 
 
 		 391 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.12 
 
 		 392 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.49 
 
 		 393 aa  607  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.69 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  55.7 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.4 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  55.41 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  55.67 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.21 
 
 		 402 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  55.67 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  55.41 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  50.52 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.22 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  55.7 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  50.52 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.12 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.97 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 385 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  54.12 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  57.51 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  58.76 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  56.22 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 387 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.77 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.94 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  35.85 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  35.85 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.08 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.02 
 
 		 386 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  34.39 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  38.72 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.39 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.94 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 		 395 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.94 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.53 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.93 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.77 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.25 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>