More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0690 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.57 
 
 
378 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  766    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  78.84 
 
 
378 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  78.57 
 
 
378 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
380 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
393 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
397 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.31 
 
 
392 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
388 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
388 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.57 
 
 
387 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  37.09 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
382 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
388 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
383 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
388 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
388 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
388 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
382 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
384 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
384 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
389 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
389 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
387 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
385 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.42 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
387 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
387 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
385 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
405 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
379 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 
387 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
385 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
385 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
386 aa  176  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
410 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
405 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
387 aa  169  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
380 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
414 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
377 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  31 
 
 
425 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
398 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
382 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
391 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
377 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
390 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
382 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
437 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
382 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1139  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
389 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
382 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
382 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.01 
 
 
387 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
387 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
384 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
410 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
428 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
399 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.95 
 
 
383 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.95 
 
 
383 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
382 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
382 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
375 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
382 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
392 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
389 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
384 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
375 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
388 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.76 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>