More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1609 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  83.25 
 
 
382 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  82.72 
 
 
382 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  84.29 
 
 
382 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  83.51 
 
 
382 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  78.8 
 
 
382 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  77.75 
 
 
382 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  78.8 
 
 
382 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  74.08 
 
 
382 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  79.06 
 
 
382 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.85 
 
 
378 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.54 
 
 
378 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.94 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.2 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.75 
 
 
378 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.49 
 
 
378 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  67.02 
 
 
378 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.45 
 
 
378 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.16 
 
 
380 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.73 
 
 
376 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 
377 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  48.56 
 
 
370 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.51 
 
 
379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.44 
 
 
377 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.78 
 
 
378 aa  325  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.9 
 
 
381 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
383 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
381 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
398 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
381 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
381 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  36.36 
 
 
386 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
377 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  36.1 
 
 
386 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  37.05 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
378 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.66 
 
 
389 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
387 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.4 
 
 
389 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
390 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 
384 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
394 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
384 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.18 
 
 
381 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.59 
 
 
382 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
384 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.59 
 
 
382 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
387 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  34.64 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  38 
 
 
393 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
385 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
388 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
387 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
387 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
387 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
387 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
393 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
383 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 
395 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
382 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.33 
 
 
393 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
382 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
394 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
383 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.43 
 
 
388 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  33.94 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  37 
 
 
388 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
387 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
382 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
385 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
393 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
382 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
382 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
382 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
387 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>