More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1139 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1139  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  801    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003574  alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  37.79 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.62 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  37.19 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.66 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  39.35 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.92 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.39 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1042  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1428  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2296  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281941  hitchhiker  0.000367197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  37.39 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 382 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  38.27 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  226  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  34.92 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  36.59 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.18 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.23 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  35.46 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  34.81 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.81 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.81 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  35.04 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.81 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.53 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.53 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  34.53 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  35.07 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.53 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  34.9 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 388 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.27 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  33.7 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  34.02 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  33.42 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  33.42 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>