More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6773 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  785    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  80.98 
 
 
389 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  80.98 
 
 
389 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.48 
 
 
402 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  66.23 
 
 
388 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  65.7 
 
 
388 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.4 
 
 
385 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 
385 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.63 
 
 
387 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 
385 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  61.32 
 
 
385 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  61.1 
 
 
385 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.54 
 
 
387 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.79 
 
 
387 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.16 
 
 
382 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 
387 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  56.44 
 
 
387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
387 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.85 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.42 
 
 
380 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
392 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 
386 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
392 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
391 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.32 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  49.48 
 
 
392 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.52 
 
 
387 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
387 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
405 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
393 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
382 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
389 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
388 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
388 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
384 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.73 
 
 
387 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
384 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
381 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
387 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
386 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
383 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
385 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
385 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
395 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
385 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
386 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
383 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
387 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
382 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
388 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
383 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  36.57 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
386 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
388 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
383 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
387 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
384 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
378 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
418 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
419 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
383 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
390 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
390 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
383 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
383 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
387 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.63 
 
 
382 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 
388 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
383 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2349  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
866 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00292479  hitchhiker  0.00000238757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
378 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.63 
 
 
382 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
385 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1898  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
865 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.715001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.01 
 
 
387 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
378 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  36.84 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
395 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
382 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>